La construction de la nouvelle église paroissiale a commencé en 1935. Avant le début de la Seconde Guerre mondiale, des murs d’une hauteur de 2,5 mètres avaient été construits, puis les travaux ont été interrompus jusqu’aux années 1960. En 1966, les travaux ont repris et ont été achevés en 1969. L’église a été bénie le 19 janvier 1969. L’aménagement intérieur de l’église a été finalisé en 1980.
Après le début des apparitions, les travaux effectués sur l’église comprennent : la création de portes latérales, des vitraux, de nouvelles cloches d’église et un orgue.
Pour l’Assomption de la Vierge en 1987, des vitraux ont été installés dans l’église, conçus par l’artiste Branimir Dorotić de Samobor. La réalisation a été effectuée par la célèbre entreprise italienne Domus Dei de Rome. Sur 28 surfaces vitrées d’une superficie totale d’environ 64 m², des motifs bibliques et contemporains ont été peintes. Du côté droit, les vitraux représentent des événements de la vie de la Vierge, tandis que du côté gauche, ils illustrent les messages les plus importants de la Vierge à Medjugorje.
Le nouveau chemin de croix, œuvre de l’artiste italien Carmelo Puzzolo, a été installé dans l’église lors du Vendredi Saint, le 13 avril 1990.
En juin 1988, quatre autres portes ont été percées dans les collatéraux de l’église, en plus des trois portes existantes sur la façade.